MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 1128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	AGG	2	6	1056	1061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209458
2	NC_015694	TGTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	338209458
3	NC_015694	TGCTGA	2	12	1131	1142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209458
4	NC_015694	TCA	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209458
5	NC_015694	AAG	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
6	NC_015694	TGA	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209458
7	NC_015694	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	338209458
8	NC_015694	TTA	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209458
9	NC_015694	TGC	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209458
10	NC_015694	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	338209458
11	NC_015694	AAG	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
12	NC_015694	TTCAA	2	10	1525	1534	40 %	40 %	0 %	20 %	338209458
13	NC_015694	TAATG	3	15	1647	1661	40 %	40 %	20 %	0 %	338209458
14	NC_015694	TAT	2	6	1732	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209459
15	NC_015694	AAAT	2	8	1747	1754	75 %	25 %	0 %	0 %	338209459
16	NC_015694	GCC	2	6	1780	1785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209459
17	NC_015694	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209459
18	NC_015694	A	6	6	1821	1826	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
19	NC_015694	AAGGT	2	10	1860	1869	40 %	20 %	40 %	0 %	338209459
20	NC_015694	GAG	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209459
21	NC_015694	TA	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	338209459
22	NC_015694	TACT	2	8	1958	1965	25 %	50 %	0 %	25 %	338209459
23	NC_015694	GAC	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209459
24	NC_015694	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
25	NC_015694	TTC	2	6	2108	2113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209460
26	NC_015694	T	6	6	2134	2139	0 %	100 %	0 %	0 %	338209460
27	NC_015694	ACC	2	6	2152	2157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209460
28	NC_015694	TAG	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
29	NC_015694	A	7	7	2249	2255	100 %	0 %	0 %	0 %	338209460
30	NC_015694	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
31	NC_015694	CGTCG	2	10	2575	2584	0 %	20 %	40 %	40 %	338209461
32	NC_015694	TTG	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
33	NC_015694	TTG	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
34	NC_015694	AGT	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209461
35	NC_015694	AAT	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
36	NC_015694	ATA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
37	NC_015694	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
38	NC_015694	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
39	NC_015694	T	7	7	3036	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
40	NC_015694	GAA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
41	NC_015694	CAG	2	6	3181	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209461
42	NC_015694	CCT	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209461
43	NC_015694	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
44	NC_015694	GT	3	6	3266	3271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209461
45	NC_015694	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	338209462
46	NC_015694	CTC	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209462
47	NC_015694	TTTTG	2	10	3439	3448	0 %	80 %	20 %	0 %	338209462
48	NC_015694	TGA	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209462
49	NC_015694	ATA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209462
50	NC_015694	G	6	6	3652	3657	0 %	0 %	100 %	0 %	338209462
51	NC_015694	ATC	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209462
52	NC_015694	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
53	NC_015694	AGC	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209463
54	NC_015694	AAT	2	6	4276	4281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209463
55	NC_015694	CAAC	2	8	4284	4291	50 %	0 %	0 %	50 %	338209463
56	NC_015694	A	6	6	4374	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
57	NC_015694	GAT	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209463
58	NC_015694	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
59	NC_015694	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
60	NC_015694	GATA	2	8	4724	4731	50 %	25 %	25 %	0 %	338209464
61	NC_015694	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
62	NC_015694	TGAC	2	8	4801	4808	25 %	25 %	25 %	25 %	338209464
63	NC_015694	GAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
64	NC_015694	GCGG	2	8	4973	4980	0 %	0 %	75 %	25 %	338209464
65	NC_015694	AGC	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209464
66	NC_015694	A	6	6	5085	5090	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
67	NC_015694	CGGA	2	8	5133	5140	25 %	0 %	50 %	25 %	338209464
68	NC_015694	GGA	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209464
69	NC_015694	A	6	6	5272	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
70	NC_015694	TAT	2	6	5891	5896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
71	NC_015694	TCA	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209465
72	NC_015694	GAT	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209465
73	NC_015694	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
74	NC_015694	TCAA	2	8	6047	6054	50 %	25 %	0 %	25 %	338209465
75	NC_015694	ATT	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
76	NC_015694	T	6	6	6115	6120	0 %	100 %	0 %	0 %	338209465
77	NC_015694	C	6	6	6167	6172	0 %	0 %	0 %	100 %	338209466
78	NC_015694	GGA	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
79	NC_015694	GAG	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
80	NC_015694	AAC	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209467
81	NC_015694	TGA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
82	NC_015694	TGTT	2	8	6749	6756	0 %	75 %	25 %	0 %	338209467
83	NC_015694	ATG	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
84	NC_015694	CTC	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209467
85	NC_015694	AAAT	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	338209467
86	NC_015694	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
87	NC_015694	CTT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209467
88	NC_015694	TA	3	6	7041	7046	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
89	NC_015694	GGCA	2	8	7145	7152	25 %	0 %	50 %	25 %	338209467
90	NC_015694	GAA	3	9	7264	7272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209468
91	NC_015694	ATAGA	2	10	7301	7310	60 %	20 %	20 %	0 %	338209468
92	NC_015694	GAT	2	6	7339	7344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209468
93	NC_015694	TAT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209468
94	NC_015694	TACT	2	8	7399	7406	25 %	50 %	0 %	25 %	338209468
95	NC_015694	A	8	8	7414	7421	100 %	0 %	0 %	0 %	338209468
96	NC_015694	CAA	2	6	7481	7486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209468
97	NC_015694	TACGAT	2	12	7536	7547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338209468
98	NC_015694	GAT	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209468
99	NC_015694	TAAAA	2	10	7647	7656	80 %	20 %	0 %	0 %	338209468
100	NC_015694	A	7	7	7653	7659	100 %	0 %	0 %	0 %	338209468
101	NC_015694	TA	3	6	7736	7741	50 %	50 %	0 %	0 %	338209468
102	NC_015694	TGAG	2	8	7754	7761	25 %	25 %	50 %	0 %	338209468
103	NC_015694	ATA	2	6	7762	7767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209468
104	NC_015694	AGA	2	6	7779	7784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209468
105	NC_015694	TAA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209468
106	NC_015694	TAT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209468
107	NC_015694	GCA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209469
108	NC_015694	ACT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209469
109	NC_015694	TGA	2	6	8276	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209469
110	NC_015694	AAG	2	6	8327	8332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209469
111	NC_015694	AGA	2	6	8333	8338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209469
112	NC_015694	TA	3	6	8355	8360	50 %	50 %	0 %	0 %	338209469
113	NC_015694	A	6	6	8438	8443	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
114	NC_015694	ATGA	2	8	8448	8455	50 %	25 %	25 %	0 %	338209469
115	NC_015694	TTTC	2	8	8460	8467	0 %	75 %	0 %	25 %	338209469
116	NC_015694	A	8	8	8498	8505	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
117	NC_015694	T	6	6	8516	8521	0 %	100 %	0 %	0 %	338209469
118	NC_015694	A	6	6	8524	8529	100 %	0 %	0 %	0 %	338209469
119	NC_015694	TTA	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209469
120	NC_015694	ATT	2	6	8564	8569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209469
121	NC_015694	TAAAAA	2	12	8589	8600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	338209469
122	NC_015694	CAA	2	6	9028	9033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209470
123	NC_015694	TGAA	2	8	9155	9162	50 %	25 %	25 %	0 %	338209470
124	NC_015694	GCA	2	6	9180	9185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209470
125	NC_015694	TTC	2	6	9198	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209470
126	NC_015694	TTA	2	6	9227	9232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209470
127	NC_015694	GTT	2	6	9387	9392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209471
128	NC_015694	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209471
129	NC_015694	ACA	2	6	9464	9469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209471
130	NC_015694	CTT	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209471
131	NC_015694	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	338209472
132	NC_015694	CTA	2	6	9585	9590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209472
133	NC_015694	T	6	6	9592	9597	0 %	100 %	0 %	0 %	338209472
134	NC_015694	GGAT	2	8	9607	9614	25 %	25 %	50 %	0 %	338209472
135	NC_015694	GTT	2	6	9731	9736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209472
136	NC_015694	GGC	2	6	9818	9823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209472
137	NC_015694	ACC	2	6	9906	9911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209472
138	NC_015694	A	6	6	9967	9972	100 %	0 %	0 %	0 %	338209472
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163	NC_015694	ATTGT	2	10	12008	12017	20 %	60 %	20 %	0 %	338209473
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263	NC_015694	TTACA	2	10	17518	17527	40 %	40 %	0 %	20 %	338209479
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400	NC_015694	TCT	2	6	24384	24389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209487
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